Sinds 2000 was Nynke werkzaam bij het Nederlands Psychoanalytisch Instituut waar zij haar psychotherapie opleiding (Systeem, Psychoanalytische en CGT) volgde en aansluitend de opleiding tot psychoanalyticus. In de loop van de jaren deed MBT hier zijn intrede, en werd dit verder ontwikkeld na de fusie met Arkin. Hierna maakte Nynke in 2012 de overstap als behandelaar naar het werken bij de intensieve MBT behandelprogramma’s. Hier werkte zij tot 2024. Naast haar werk is Nynke werkzaam in eigen praktijk en geeft zij met regelmaat les bij onder andere de RINO.